Панель nCounter Alzheimer’s disease (AD) разработана на основе технологии NanoString для анализа экспрессии 770 генов 30  сигнальных путей, охватывающих 30 клинически полученных модулей в исследовании AMP-AD консорциума, ассоциированных с болезнью Альцгеймера.

Панель позволяет:  

• Комплексно оценить 30 модулей коэкспрессии генов,, ассоциированных с болезнью Альцгеймера, включая 23 сигнальных пути и процесса нейродегенерации
• Провести воспроизводимый мониторинг прогрессирования болезни Альцгеймера с возрастом.
• Провести функциональный скрининг потенциальных терапий болезни Альцгеймера 

Покрытие регионов мозга 

Данные RNA-seq из 7 областей головного мозга, сгенерированные 3 отдельными посмертными исследованиями болезни Альцгеймера, анализировали с помощью анализа взвешенных сетей коэкспрессии генов (weighted gene coexpression network analysis, WGCNA) который обнаруживает кластеры коэкспрессированных генов в данных часто коррелирующих с известными биологическими функциями или типами клеток.  Аннотации, включенные в эту панель, представляют собой полученные  кластеры или модули экспресии генов названные по региону мозга, где они были обнаружены, и по присвоенному цвету. Контент внутри модуля предполагает коэкспрессию генов, связанных с нейронами, микроглией и астроцитами.

Регион мозга		Описание	Ассоциированные гены мышь/человек
Дорсолатеральная префронтальная кора (DLPFC)		DLPFC - это корковая структура, которая поддерживает более высокие когнитивные функции, включая рабочую память и речевые способности. Префронтальная кора  уязвима для нейродегенерации при здоровом старении и болезни Альцгеймера	655/657
Височная кора (TCX)		TCX - корковая область мозга, расположенная в височных долях. Височные доли играют важную роль в организации сенсорного ввода, слухового восприятия, языковой и речевой продукции, а также обработке и формировании памяти.  Повреждение TCX может привести к проблемам с памятью, пониманием языка и эмоций. При болезни Альцгеймера обнаруживаются нейропатологические и нейрохимические изменения.	655/659
Мозжечок (CBE)		Расположенный сзади в мозге, CBE играет важную роль в произвольном движении, моторном обучении и языке. CBE  избавлен от классического проявления нейропатологий болезни  Альцгеймера, но данные указывают на другие изменения связанные с заболеванием	626/627
Нижняя лобная извилина (IFG)		IFG образует боковую и нижнюю поверхность лобной доли, играет роль в торможении, понимании речи и языка. IFG показывает возрастную атрофию и наличие нейропатологических изменений при болезни  Альцгеймера.	678/681
Верхняя височная извилина (STG)		Верхняя височная извилина STG является одной из трех извилин в височной доле. Она состоит из первичной слуховой коры и зоны Вернике, которая участвует в понимании языка. Эта область мозга показывает нейродегенеративные изменения при болезни  Альцгеймера, соответствующие стадии 4 Браака.	630/632
Фронтальный столб (FP)		FP префронтальной коры соответствует передней наиболее округлой точке лобной доли.  Эта область мозга вовлечена в широкий спектр функции, включая когнитивную обработку и является обхектом атрофии при  болезни  Альцгеймера	646/649
Парагиппокампальная извилина (PHG)		PHG - это кортикальная область в средней височной доле, которая окружает гиппокамп и играет важную роль как в пространственной памяти, так и в навигации. Кортикальные области, которые образуют PHG, уязвимы для патологических изменений при болезни  Альцгеймера, а его энторинальные и периринальные подразделения сильно повреждены при заболевании и находятся в центре его возникновения.	672/679

Функциональная аннотация панели 

Контент включенный в панель представляет собой транскриптомный отпечаток изменений при болезни  Альцгеймера, который может быть сравнен между мышиными моделями и тканями человека.