Панель nCounter Human Organ Transplant разработана на основе технологии NanoString для анализа экспрессии 770 генов 37 сигнальных путей чтобы идентифицировать биомаркеры для отторжения, раскрыть механизмы повреждения тканей и изучить токсичность, вызванной иммунодепрессантами.
Панель позволяет:
- Изучить иммунный ответ на трансплантированную ткань и проанализировать пути, участвующие в иммуносупрессии
- Открывать новые биомаркеры на отторжение органов и повреждение тканей почек, сердца, печени и легких
- Оценить влияние иммуносупрессивных лекарств на сигнальные пути
- Понять механизмы, лежащие в основе лекарственной токсичности
- Выявить полиомавирус, цитомегаловирус и вирус Эпштейна-Барра.
- Оценить количество иммунных клеток относительного различных групп и образцов - В-клетки, дендритные клетки, истощенные CD8 Т-клетки, макрофаги, Т-клетки, CD8 Т-клетки, нейтрофилы, тучные клетки, цитотоксические клетки, регуляторные Т-клетки, NK CD56dim клетки, NK клетки, CD45+ клетки, Th1 клетки.
Панель nCounter Human Organ Transplant была создана в сотрудничестве с Banff Foundation for Allograft Pathology - глобальным консорциумом исследователей в который входят такие известные центры как University of Alberta, Erasmus Medical Center Rotterdam, Imperial College London, Massachusetts General Hospital, University of Oxford и Paris Transplant Group. Консорциум нацелен на улучшение результатов трансплантации органов посредством продвинутой молекулярной характеризации ответа аллотрансплантата in-situ и предоставления современного подхода к исследованиям новых биомаркеров отторжения, раскрытия механизмов повреждения тканей и мониторинга токсичности, вызываемой иммунодепрессантами и инфекциями.
Функциональная аннотация панели
Ангиогенез
|
Врожденная иммунная система
|
|
Th1 дифференциация
|
Апоптоз и регуляция клеточного цикла
|
Lymphocyte Trafficking
|
|
Th17 дифференциация
|
Аутофагия
|
MAPK
|
|
Th17 опосредованная биология
|
Сигналинг B-клеточного рецептора
|
Метаболизм
|
|
Th2 дифференциация
|
Взаимодействие клетка-ECM
|
Презентация антигена МНС класса I
|
|
Тканевый гомеостаз
|
Хемокиновый сигналинг
|
Презентация антигена МНС класса II
|
|
Сигналинг семейства TNF
|
Система комплемента
|
mTOR
|
|
Сигналинг Toll-like рецептора
|
Цитокиновый сигналинг
|
NF-kappaB сигналинг
|
|
Treg дифференциация
|
Cytosolic DNA Sensing
|
NLR сигналинг
|
|
Type I интерфероновый сигналинг
|
Цитотоксичность
|
Оксидативный стресс
|
|
Type II интерфероновый сигналинг
|
Эпигенетика и транскрипция
|
T-cell Checkpoint сигналинг
|
|
Детекция вирусов
|
Гематопоез
|
Сигналинг T-клеточного рецептора
|
|
Производитель:
NanoString
Количество мишеней:
770 (человек) включая референсные гены
Стандартное количество материала (не требует амплификации) :
25 - 300 нг
Малое количество материала:
Всего 1 нг с набором nCounter Low Input и пулами праймеров для конкретных панелей (продаются отдельно)
Тип образца:
Культуры клеток/клеточный лизат, сортированые клетки, РНК полученная из FFPE, тотальная РНК, фрагментированная РНК, мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC), цельная кровь/плазма
Кастомизация:
Возможность добавления до 30 генов-мишеней с помощью системы Panel-Plus
Время до результата:
Примерно 24 часа. Время работы руками 15 минут
Анализ данных:
Программное обеспечение nSolver, модуль Advanced Analysis
Направление деятельности:
Онкодиагностика