Панель nCounter Fibrosis разработана на основе технологии NanoString для анализа экспрессии 770 генов из более 51 сигнального пути вовлеченных в биологию формирования фиброзных заболеваний. Эта панель объединяет сотни генов, участвующих в начальной реакции повреждения ткани, хроническом воспалении, пролиферации профиброзных клеток и модификации ткани приводящей к фиброзным заболеваниям легких, сердца, печени, почек и кожи.
Панель позволяет:
Изучить патогенез и выявить биомаркеров при фиброзных заболеваниях легких, сердца, печени, почек и кожи
Выяснить механизм действия четырех стадий фиброза: инициация, воспаление, пролиферация и модификация.
Понять сигнальный каскад от клеточного стресса до воспаления
Оценить количество иммунных клеток относительного различных групп и образцов - В-клетки, дендритные клетки, истощенные CD8 Т-клетки, макрофаги, Т-клетки, CD8 Т-клетки, нейтрофилы, тучные клетки, цитотоксические клетки, регуляторные Т-клетки, NK CD56dim клетки, NK клетки, CD45+ клетки, Th1 клетки
Охват генов по четырем стадиям
Стадия
Описание
Сигнальные пути
Число генов человека
Число генов мыши
Инициация
Ряд клеточных сигнальных путей и процессов, особенно при дизрегуляции в контексте заболевания, могут вызывать повреждение тканей. Эти источники повреждения тканей часто специфичны для органов, но некоторые могут быть более общими.
Аутофагия, метаболизм холестерина, Cytosolic DNA Sensing, De Novo липогенез, ответ эндотоксинов, метаболизм жирных кислот, глюконеогенез, резистентность к инсулину, инсулиновый сигналинг, MAPK клеточный стресс, mTOR, оксидативный стресс, PPAR сигналинг, протеотоксический стресс, SASP
297
297
Воспаление
В ответ на повреждение различные типы иммунных клеток инфильтрируют поврежденные ткани и инициируют воспаление. Макрофаги и Т-клетки являются основным источником этого воспаления, и пути, вызываемые ими, влияют как на иммунную, так и на функцию резидентных клеток.
Сигнальный путь аденозина,хемокиновый сигналинг, активация комплемента, цитокиновый сигналинг, активность гранулоцитов, инфламмасома, активация M1, активация M2, презентация антигена MHC класса II, дегрануляция нейтрофилов, NF-kb, фагоцитарная функция клеток, дегрануляция тромбоцитов, дифференцировка Th1, дифференцировка Th17, дифференцировка Th2, TLR сигналинг,интерферон типа I, интерферон типа II
369
369
Пролиферация
Реакция на воспаление включает пролиферацию и функцию различных типов клеток, но наиболее заметными являются миофибробласты. Эти миофибробласты передают сигналы по различным путям, чтобы способствовать их собственному выживанию и, в конечном счете, модификации тканей.
Стандартное количество материала (не требует амплификации) :
25 - 300 нг
Малое количество материала:
Всего 1 нг с набором nCounter Low Input и пулами праймеров для конкретных панелей (продаются отдельно)
Тип образца:
Культуры клеток/клеточный лизат, сортированые клетки, РНК полученная из FFPE, тотальная РНК, фрагментированная РНК, мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC), цельная кровь/плазма
Кастомизация:
Возможность добавления до 30 генов-мишеней с помощью системы Panel-Plus
Время до результата:
Примерно 24 часа. Время работы руками 15 минут
Анализ данных:
Программное обеспечение nSolver , модуль Advanced Analysis