Панель nCounter Autoimmune Profiling разработана на основе технологии NanoString для анализа экспрессии 770 генов 35 сигнальных путей и процессов, связанных с аутоиммунными и хроническими воспалительными заболеваниями.
Панель позволяет:
Провести исследование аутоиммунных заболеваний, хронических воспалительных заболеваний, дисфункции иммунной системы, стресса и повреждений тканей, а также воспалительных сигналов.
Оценить количество иммунных клеток относительного различных групп и образцов - В-клетки, дендритные клетки, истощенные CD8 Т-клетки, макрофаги, Т-клетки, CD8 Т-клетки, нейтрофилы, тучные клетки, цитотоксические клетки, регуляторные Т-клетки, NK CD56dim клетки, NK клетки, CD45+ клетки, Th1 клетки
Функциональная аннотация
35 путей и процессов, которые покрывает панель, обеспечивают комплексное представление о дисфункции иммунной системы при аутоиммунных заболеваниях и побочных эффектах иммунной системы, вызванных лечением.
Аутоантигены
Апоптоз
Аутофагия
Сигналинг B-клеточного рецептора
Хемокиновый сигналинг
Система комплемента
Cytosolic DNA Sensing
Цитотоксичность
Эндотелиальная активация
Эпигенетический и транскрипционный сигналинг
Fc-рецепторы и фагоцитоз
Сигналинг факторов роста
Иммунометаболизм
Инфламмасома
Интерлейкин-12 сигналинг
Сигналинг других интерлейкинов
Lymphocyte Trafficking
Презентация антигена МНС класса I
Презентация антигена МНС класса II
mTOR
NF-kB сигналинг
NLR сигналинг
Оксидативный стресс
T-cell Checkpoint сигналинг
Сигналинг Т-клеточного рецептора
TGF-Beta сигналинг
Th1 дифференциация
Th2 дифференциация
Th17 дифференциация
Th17 опосредованная биология
Сигналинг TNF семейства
Сигналинг Toll-like рецептора
Treg дифференциация
Type I интерфероновый сигналинг
Type II интерфероновый сигналинг
Панель nCounter Autoimmune Profiling была сконструирована для охвата адаптивной и врожденной дисфункции иммунной системы. В таблице ниже описаны шесть заболеваний, на которые обращалось особое внимание при создании этой панели.
Заболевание
Описание
Ревматоидный артрит
Хроническое воспалительное заболевание, которое влияет на слизистую оболочку суставов.
Воспалительное заболевание кишечника
Хроническое воспаление пищеварительного тракта.
Диабет I типа
Аутоиммунное заболевание, при котором иммунная система по ошибке атакует инсулин-продуцирующие клетки поджелудочной железы.
Рассеянный склероз
Демиелинизирующее заболевание, которое нарушает связь в нервной системе.
Системная красная волчанка
Хроническое воспалительное заболевание, которое проявляется системно по всему организму.
Псориаз
Иммуноопосредованное заболевание, вызывающее быстрое накопление клеток кожи на поверхности кожи.
Индуцированные неблагоприятные иммунные события
Сообщается, что некоторые виды лечения и инфекции влияют на иммунную систему и вызывают ряд аутоиммунных заболеваний или неблагоприятных событий, связанных с иммунитетом.
Производитель:
NanoString
Количество мишеней:
770 (человек)/770(мышь) включая референсные гены
Объект:
Человек, Мышь
Аналит:
РНК
Направление:
Иммунология
Стандартное количество материала (не требует амплификации) :
25 - 300 нг
Тип образца:
РНК полученная из FFPE, Тотальная РНК, Фрагментированная РНК, Клеточный лизат, Мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC), Цельная кровь/плазма
Кастомизация:
Возможность добавления до 30 генов-мишеней с помощью системы Panel-Plus
Время до результата:
Примерно 24 часа. Время работы руками 15 минут
Анализ данных:
Программное обеспечение nSolver, модуль Advanced Analysis